Denne avgiften er lovregulert og blir innbetalt av bøndene som en avgift per kilo ved slakting og ved førstegangsomsetning av egg. Innbetaling av omsetningsavgift går til tre ulike fond; fondet for storfe, svin og sau/lam, fondet for kylling og kalkun og fondet for egg.
I tillegg til omsetningsavgiftsmidlene har Animalia inntekter fra salg av tjenester og produkter samt at Animalia søker støtte til forsknings- og utviklingsprosjekter fra offentlige prosjektfinansieringskilder som Norges forskningsråd, forskningsmidler over Jordbruksavtalen, fondet for forskningsavgift for landbruksprodukter, Innovasjon Norge og EU-midler.
Til utvikling og drift av bransjefelles oppgaver ble det forbrukt 60,8 mill. kr av omsetningsavgiftsmidler i 2017. Inntekt fra prosjekter, oppdrag og salg av materiell beløp seg til 38 mill. kr.